奨励賞
平成23年度 (2011/10/24UP)
加藤 裕教 氏（京都大学）
「神経回路形成における低分子量Ｇ蛋白質Rhoファミリーの役割」
平田 普三 氏（国立遺伝学研究所）
「運動システムの発達における神経系と筋の分化・形成」
内村 健治 氏（国立長寿医療研究センター/名古屋大学大学院）
「糖鎖硫酸化反応とその生物機能」
野尻 正樹 氏（大阪大学）
「生物学的脱窒過程における蛋白質分子間電子伝達反応の構造基盤」
平成22年度
石水 毅氏 (大阪大学大学院理学研究科)
「植物N-結合型糖鎖の分解機構の解明」
岡島 徹也 氏 (名古屋大学大学院医学系研究科)
「糖タンパク質・糖脂質糖鎖の生合成に関わる新規糖転移酵素群の機能に関する研究」
豊島 文子 氏 (京都大学ウイルス研究所)
「細胞分裂軸を決める新たな分子機構の発見と解析」
三原 久明 氏 (立命館大学生命科学部)
「鉄硫黄クラスターおよびセレンタンパク質の生合成を司る硫黄・セレン脱離酵素群の発見と分子機能解析」
平成21年度
佐藤 健 氏 (東京大学)
「小胞体における輸送小胞形成の分子メカニズムの解析」
進藤 英雄 氏 (東京大学)
「新規リゾリン脂質アシル転移酵素群の発見と解析」
伊藤 俊樹 氏 (神戸大学)
「エンドサイトーシスにおける細胞膜の形状制御機構」
石原 直忠 氏 (東京医科歯科大学)
「融合と分裂によるミトコンドリア形成制御の分子機構と生理機能」
田中 智之 氏 (武庫川女子大学)
「マスト細胞の機能制御に関わる分子機構の解析」
平成20年度
川根 公樹 氏 (京都大学大学院医学研究科)
「DNA分解酵素の生理作用の解析」
山内 淳司 氏 (国立成育医療センター研究所／東京工業大学大学院)
「末梢神経ミエリン形成を司るシグナル伝達経路」
匂坂 敏朗 氏 (神戸大学大学院医学研究科)
「小胞輸送による神経軸索形成機構」
佐藤 健 氏 (群馬大学生体調節研究所)
「膜タンパク質の小胞体局在化メカニズムの解明」
山田 康之 氏 (立教大学)
「ATP合成酵素の活性調節におけるεサブユニットの役割」
平成19年度
村田 茂穂 氏 (東京都臨床医学総合研究所)
「プロテアソームによる適応免疫システム制御に関する研究」
山本 英樹 氏 (広島大学大学院医歯薬学総合研究科)
「Wntシグナルによる細胞応答制御の分子機構」
吉田 清嗣 氏 (東京医科歯科大学難治疾患研究所)
「DNA損傷におけるアポトーシス誘導機構の解析」
平成18年度
榎本 和生 氏 (国立遺伝学研究所)
「リン脂質分子の膜動態と細胞骨格制御に関する研究」
小松 雅明 氏 (順天堂大学医学部)
「オートファジーの病態生理学的研究」
橋本 義輝 氏 (筑波大学大学院生命環境科学研究科)
「イソニトリル・ニトリルの新規代謝経路の発見と新規酵素の分子機能解析」
平成17年度
北爪 しのぶ 氏(理化学研究所フロンティア研究システム)
「アルツハイマー病βセレクターゼによる糖転移酵素の切断」
木原 章雄 氏(北海道大学大学院薬学研究科)
「スフィンゴ脂質シグナリングと膜動態の解明」
杉本 幸彦 氏(京都大学大学院薬学研究科)
「プロスタグランジンE受容体全4種とプロスタグランジンF受容体の構造と機能の解明」
鈴木 匡 氏(大阪大学大学院医学系研究科)
「細胞質PNGaseの構造と機能の研究」
村松 正道 氏(京都大学大学院医学研究科)
「クラススイッチを司る遺伝子AIDの発見とその機能解析」
平成16年度
東原 和成 氏（東京大学大学院新領域創成科学研究科）
「嗅覚受容体の構造と機能に関する研究」
福田 光則 氏（理化学研究所福田独立主幹研究ユニット）
「シナプトタグミン及びその類似蛋白質による膜輸送制御の分子メカニズム」
伊東 健 氏（筑波大学先端学際領域研究センター／基礎医学系）
「Keap1/Nrf2 制御系による酸化ストレス防御機構の解明」
尾藤 晴彦 氏（東京大学大学院医学系研究科）
「神経形態可塑性を制御するシグナルに関する研究」
柳 茂 氏（神戸大学大学院医学系研究科）
「神経回路形成における反発因子セマホリンを介するシグナル伝達機構の解析」
平成15年度
田村 茂彦 氏（九州大学大学院理学研究院）
「先天性ペルオキシソーム欠損症における病因遺伝子と細胞機能障害」
寺田 和豊 氏（熊本大学大学院医学薬学研究部）
「サイトソル分子シャペロン系の機能解析」
吉田 秀郎 氏（京都大学大学院生命科学研究科／科学技術振興事業団さきがけ）
「高等動物の小胞体ストレス応答の分子機構」
凌 楓 氏（理化学研究所遺伝生化学研究室）
「ミトコンドリア遺伝の基本分子機構」
平成14年度
北川 裕之 氏（神戸薬科大学生化学研究室）
「癌抑制遺伝子EXTファミリーと硫酸化グリコサミノグリカンの生合成」
後藤 知己 氏（熊本大学医学部分子遺伝学講座）
「一酸化窒素（NO）の産生制御とNO誘導性アポトーシスに関する研究」
津本 浩平 氏（東北大学大学院工学研究科）
「抗原抗体相互作用における特異性・親和性創出機構の精密解析」
平成13年度
岩田 修永 氏（理化学研究所脳科学総合研究センター）
「β-アミロイドペプチドの脳内分解システムの解明」
三木 裕明 氏 （東京大学医科学研究所腫瘍分子医学分野）
「WASPファミリー蛋白による細胞骨格再構成の研究」
水島 昇 氏 （岡崎国立共同研究機構基礎生物学研究所）
「オートファジーの分子機構に関する研究：Apg12結合システムの役割」
本橋 ほづみ 氏 （筑波大学先端学際領域研究センター）
「小 Maf 群転写因子による転写制御ネットワーク形成と生体機能制御の分子機構の解明」
横溝 岳彦 氏 （東京大学大学院医学系研究科）
「ロイコトリエンB4の代謝と受容体に関する研究」
平成12年度
沢村 達也 氏 （国立循環器病センター）
「レクチン様酸化LDL受容体（LOX-1）の発現とその生理的意義の解明」
竹島 浩 氏 （久留米大学分子生命科学研究所）
「細胞内ストアのカルシウム放出に関する研究」
中西 真 氏 （名古屋市立大学医学部）
「細胞周期チェックポイント機構による染色体安定性維持に関する研究」
花田 賢太郎 氏 （国立感染症研究所細胞化学部）
「高等動物細胞におけるスフィンゴ脂質の生合成と細胞内輸送」
松田 文彦 氏 （Centre de National Genotypage, Fr）
「ヒト免疫グロブリンH 鎖可変部領域遺伝子群の構造解析」
平成11年度
依馬 正次 氏 （Samuel Lunenfeld Res. Inst.）
「bHLH-PAS型転写因子群の構造とその生理機能」
反町 洋之 氏 （東大・分生研）
「カルパイン及びそのホモログの構造・機能解析」
西山 賢一 氏 （東大・分生研）
「分泌蛋白質の膜透過分子機構に関する研究：膜透過を駆動するSecA-SecGの構造変化」
宮澤 恵二 氏 （東工大・生命理工）
「肝細胞増殖因子の活性発現の分子機構の研究」
保田 尚孝 氏 （雪印乳業・生物研）
「破骨細胞の分化・成熟を調節するメカニズムに関する研究」
平成10年度
五十嵐 和彦 氏 （筑波大・基礎医学・現東北大・医）
「グロビン遺伝子LCRに作用する転写因子群の機能の解析」
江成 政人 氏 （阪大・医）
「アポトーシスのシグナル伝達機構の解析」
澁谷 浩司 氏 （岡崎国立共同研究機構・基生研）
「TGF-βシグナル伝達系におけるTAB1-TAK1の役割」
姫野 俵太 氏 （弘前大・農）
「tmRNAによるtrans-translationに関する研究」
吉村 昭彦 氏 （久留米大・分子生命研）
「サイトカイン受容体の情報伝達と制御に関する研究」
平成9年度
緒方 一博 氏 （横浜市大・医）
「転写因子 Myb による DNA 認識と構造的揺らぎの役割」
門松 健治 氏 （名大・医）
「ヘパリン結合性成長因子，ミッドカインの発見と機能解析」
久下 理 氏 （国立感染研・細胞化学）
「動物細胞におけるホスファチジルセリンの生合成機構とその調節機構に関する遺伝性化学的研究」
森 和俊 氏 （HSP 研）
「小胞体から核への細胞内 Unfolded Protein-Response の解析」
横山 知永子 氏 （国立循環器病セ・研）
「シクロオキシゲナーゼ系酵素の分子生物学的研究：遺伝子と酵素蛋白の構造およびその発現」
平成8年度
今本 尚子 氏 （阪大・医）
「核タンパク質輸送の分子機構の解析」
高澤 伸 氏 （東北大・医）
「サイクリックADPリボースをセカンドメッセンジャーとするインスリン分泌」
田中 一馬 氏 （阪大・医）
「低分子量GTP結合タンパク質RasとRhoの活性制御機構と作用機構の解明」
鍔田 武志 氏 （京大・医）
「Bリンパ球アポトーシスの制御機構の研究」
深水 昭吉 氏 （筑波大・応用生物）
「アンジオテンシン情報伝達系の発生工学的研究」
平成7年度
岡田 雅人 氏 （阪大・蛋白研）
「Srcファミリーキナーゼの活性制御因子として機能するチロシンキナーゼCskの解析」
垣塚 彰 氏 （京大・医）
「ドミナントミューテイションとその表現型の解析：レチノイドの生理作用の解明とマシャドー・ジョゼフ病原因遺伝子の同定」
川畑 俊一郎 氏 （九大・理）
「カブトガニ血球細胞内大・小顆粒に含まれるディフェンスモレキュル群の発見と構造解明」
西道 隆臣 氏 （都臨医研・遺伝情報研）
「蛋白質分解反応を捕捉する新しい方法を用いた脳虚血およびアルツハイマー病におけるプロテアーゼの作用の解析」
阪口 雅郎 氏 （九大院・医学系）
「膜蛋白質の膜への組み込みと膜内トポロジー形成を支配する分子内シグナル配列の解明」
平成6年度
影山 龍一郎 氏 （京大・医）
「ヘリックス・ループ・ヘリックス型転写制御因子HES群による神経分化制御機構」
高尾 敏文 氏 （阪大・蛋白研）
「質量分析によるタンパク質の構造解析」
中山 和久 氏 （筑波大・生物科学）
「生理活性ペプチドおよびタンパク質前駆体のプロセシング酵素に関する研究」
福永 理己郎 氏 （大阪バイオ研）
「顆粒状コロニー刺激因子受容体の構造および機能解析」
諸橋 憲一郎 氏 （九大・医）
「ステロイドホルモン生合成に関与するP-450の遺伝子の構造と発現調節機構」
平成5年度
根岸 学 氏 （京大・薬）
「プロスタグランジンE受容体の構造と機能の研究」
本間 好 氏 （都老人研）
「イノシトールリン脂質特異的ホスホリパーゼCの構造と機能に関する研究」
多賀谷 光男 氏 （阪大・産研）
「ヌクレオチド結合部位に対する新しい親和標識試薬の開発と部位特異的変異導入」
滝口 正樹 氏 （熊本大・医）
「オルニチンサイクル酵素遺伝子の肝臓選択的転写の制御機構」
中里 雅光 氏 （宮崎医大・医）
「2つの異なったタイプのアミロイドーシスの発症機序に関する生化学的研究一家族性アミロイドーシスの異常トランスサイレチンと糖尿病の islet amyloid polypeptide（amylin）の研究から」